Priebeh volieb bol bezproblémový, Ústredná volebná komisia riešila len menšie problémy, ako napríklad problémy s plentou v jednej z volebných miestností v Bratislave či údajných podnapitých členov okrskovej volebnej komisie v malej obci na východe Slovenska. Anonymný podnet na podnapitú okrskovú komisiu však na mieste vyvrátila kontrola príslušnej obvodnej volebnej komisie. Komisia riešila aj sťažnosť na Smer-SD, ktorá cez SMS správy vyzývala na účasť vo voľbách a na hlasovanie v ich prospech. Zákon o eurovoľbách však nepovažuje posielanie SMS správ za porušenie moratória. Preto komisia označila podnet za neopodstatnený.