Pre poskytovateľov zdravotnej starostlivosti nevyplýva podľa ministerstva zdravotníctva po vstupe do Európskej únie povinnosť zavádzať certifikované systémy kvality. V nových reformných zákonoch sa však navrhuje podobná povinnosť. Kontrolu nepretržitého zabezpečovania systému kvality by mal zabezpečovať orgán vydávajúci licenciu, teda samosprávny kraj alebo ministerstvo zdravotníctva a za porušenie tejto povinnosti môže udeliť opakovane sankcie až do výšky 100 000 Sk. Predpokladá sa, že tlak na zvyšovanie úrovne kvality poskytovanej zdravotnej starostlivosti aj vyžadovaním certifikátov kvality budú vytvárať najmä zdravotné poisťovne. V novom systéme budú uzatvárať zmluvy s poskytovateľmi na základe výberového konania a poskytovateľ s certifikovaným systémom kvality bude zrejme vo výhode. Certifikát je však platný, len ak ho vydá autorizovaná organizácia. Koordinačným orgánom je v tomto prípade Úrad pre normalizáciu a metrológiu Slovenskej republiky, ktorý spolupracuje so Slovenskou národnou akreditačnou službou pri autorizácii certifikačných orgánov na systémy kvality v SR. Po vstupe do EÚ však bude potrebné brať do úvahy aj organizácie autorizované v iných štátoch.