Financovanie stredných škôl a školských zariadení od 1. júla 2002 v zriaďovateľskej pôsobnosti samosprávnych krajov je najhorúcejším problémom, ktorý treba riešiť v oblasti stredného školstva. Samosprávne kraje za súčasných podmienok nebudú schopné zvládnuť financovanie škôl, a preto treba hľadať a prijímať opatrenia na zvýšenie racionalizácie a efektívnejšie riadenie týchto zariadení. V piatok počas rokovania konferencie predsedov VÚC sa na tom v Košiciach zhodli predsedovia samosprávnych krajov a minister školstva SR Martin Fronc. Pre zvýšenie cien energií od 1. januára 2003 štát vyčlenil samosprávnym krajom v rozpočte na tento rok na prevádzku stredných škôl a zariadení vyše 2,4 mld. Sk, teda o 5 % viac ako vlani. Samosprávy to však nepovažujú za adekvátne zvýšenie. Šéfovia regionálnych samospráv poukázali aj na rozdielne financovanie školských majetkov medzi jednotlivými krajmi, dualizmus pri riadení stredných škôl a špeciálnych škôl i školských zariadení, ale aj na neefektívny systém rozdeľovania financií podľa počtu tried na školách. Podľa ministra Fronca rezort pripravuje k septembru 2004 účinnosť novely zákona o financovaní stredných škôl a školských zariadení, ktorá zmení systém rozdeľovania financií podľa počtu žiakov a vyvolá väčší tlak na efektívnejšie využívanie financií. Predpokladanou reakciou škôl zrejme bude zvyšovanie počtu stredoškolákov v triedach. Ministerstvo podľa Fronca podporí návrhy samospráv na zlučovanie stredných škôl s počtom žiakov nižším ako 25 % kapacít školy. S týmto cieľom rezort pripravil zmenu vyhlášky č. 80, ktorá výraznejšie urýchli doteraz 17-mesačný schvaľovací proces. Samosprávy chcú aj zmenu pri vymenúvaní riaditeľov stredných škôl z neobmedzeného času na štvor- až päťročné funkčné obdobie s následným výberovým konaním