Účtovanie softvéru u podnikateľov upravuje novela zákona o dani z príjmov. "Na jej základe sa bude odpisovať softvér aj pre daňové účely v súlade s účtovným odpisovým plánom," informovala členka Prezídia Slovenskej komory daňových poradcov Marta Stohlová. Podľa jej slov doteraz existoval nesúlad medzi zákonom o dani z príjmov a zákonom o účtovníctve. Zatiaľ čo prvý určoval softvér ako nehmotný majetok v prípade, že jeho vstupná cena presiahne 50-tisíc Sk a doba použiteľnosti je dlhšia ako jeden rok, a stanovoval, že takýto majetok sa odpíše do 5 rokov od jeho obstarania v súlade s účtovnými predpismi, druhý, teda zákon o účtovníctve dobu odpisovania softvéru v období 5 rokov nenariaďoval. Podľa hovorcu Business Software Alliance Romana Karabelliho môže byť správny postup pri účtovnej evidencii softvéru pre firmu veľkým prínosom v prípade, že ju polícia preveruje kvôli podozreniu z používania nelegálneho softvéru. Podľa skúseností združenia BSA majú totiž mnohé spoločnosti pri kontrole problém nájsť všetky účtovné doklady a licenčnú dokumentáciu k nadobudnutému softvéru. Častokrát i preto, že ich skartujú v čase, keď dané programy ešte stále používajú. Pri správnej účtovnej evidencii však môže vedenie firmy ľahko preukázať, aký softvér spoločnosť skutočne používa a kde je nainštalovaný.