Príjmy prevádzkovateľov vodných diel na Slovensku pochádzajú z viacerých zdrojov, predovšetkým za využitý hydroenergetický potenciál Slovenskými elektrárňami, ktoré vlastnia elektrárenský majetok. Povodie inkasuje aj za dodávky povrchovej vody poľnohospodárom a priemyslu. V niektorých prípadoch pristupujú aj účelové štátne dotácie na konkrétne úpravy alebo údržby tokov. Vodohospodári ich však považujú za nedostatočné. Zákon o vodách, platný od júla 2002, upravil novým spôsobom vzťahy medzi vodohospodármi a energetikmi. Nariadil povinnosť spoplatniť úžitky z povrchových vôd aj pri využívaní ich hydroenergetického potenciálu zariadením s výkonom vyšším ako 100 kW. Výšku platieb a ďalšie podrobnosti malo stanoviť vládne nariadenie, to však doteraz nevyšlo. Až na jeho základe bude možné nahradiť doterajší, podľa vodohospodárov nevyhovujúci zmluvný vzťah medzi prevádzkovateľmi vodných diel a elektrárňami o využívaní vody na výrobu elektriny novým. Od novembra 2001, po tom, čo sa do záležitosti zainteresovala vláda, sa podarilo uzavrieť zmluvný vzťah pri výrobe elektriny na Vodnom diele Gabčíkovo. Odvtedy Vodohospodárska výstavba inkasuje za každú vyrobenú megawatthodinu 60 percent z priemernej ceny elektriny, akú by SE dosiahli pri výrobe v iných zdrojoch. SE -- zvyčajný zmluvný partner správcov vôd, sú teraz v procese privatizácie. Z rokovaní privatizačnej komisie preniklo, že najväčší záujem investorov je práve o vodné elektrárne. Potvrdil to aj predstaviteľ belgického Electrabelu Jean-Claude Dorcimont v rozhovore pre Trend, kde vyslovil želanie vstúpiť len do vodných elektrární vo vlastníctve SE. Netajil sa víziou technologickej spolupráce s poľskými uhoľnými elektrárňami, kam Electrabel investoval do zdrojov s celkovým výkonom 1 800 MW.