Podľa predsedu NKÚ Jána Jasovského je poslaním úradu na porušenie zákonov upozorniť, za riešenie je sú však už zodpovední iní. "Nedostatkami, ktoré zistí NKÚ, sa má zaoberať exekutíva, ministerstvá, vláda a vyvodzovať dôsledky môžu výbory Národnej rady SR." Jasovský však plánuje zefektívniť činnosť úradu pružnejšou organizačnou štruktúrou. Kontroly chce zároveň vykonávať v kratšom časovom rozpätí, aby ich výsledky mohli byť rýchlejšie a jednoznačnejšie. Už počas prípravy záverov z kontrol bude výsledky konzultovať s generálnou prokuratúrou a posudzovať, či nejde o podnety aj pre orgány činné v trestnom konaní alebo či ich nemá ešte podložiť ďalšími dokladmi. Upozornil na nízke priemerné platy zamestnancov úradu, vlani to bolo 25 520 korún. Aj z tohto dôvodu má podľa neho úrad vysoký vekový priemer zamestnancov, 48,3 roka. "Najviac pracovníkov je starších ako 51 rokov. Zo 170 výkonných kontrolórov je iba 13 do 35 rokov." Za jednu z najdôležitejších považuje kontrolu nakladania so zdrojmi z európskych fondov. Očakáva, čo urobí parlament s problémom chýbajúcej nezávislej kontroly v mestách a obciach. Podľa neho samospráva má reálne zriadených iba 10 percent svojich kontrolórov, na NKÚ sa obracajú nespokojní občania s množstvom podnetov a listov so sťažnosťami na primátorov a starostov, alebo na neférové výberové konania. "Objektívne skutočnosti hovoria, že v samospráve je potrebný systém vnútornej kontroly, ktorý treba prikryť vonkajším systémom kontroly." NKÚ pripravuje svoju štruktúru tak, aby mohol zvládnuť aj kontrolu v mestách a obciach, keď o nej parlament rozhodne. Aj podľa prezidentky Transparency International Slovensko Emílie Sičákovej-Beblavej by samosprávu mal kontrolovať NKÚ, pretože hospodári aj so štátnymi a s verejnými prostriedkami.