Slovenský futbal bude v súťaži Intertoto cup 2006/2007 reprezentovať FC Nitra. Oznámil to hovorca Slovenského futbalového zväzu Klaudo Slančo. Pôvodne mal Slovensko na základe tabuľkového umiestnenia v Corgoň lige v tejto súťaži zastupovať MŠK Žilina. Ten sa však kvôli rekonštrukcii svojho štadióna do súťaže neprihlásil. Miesto Žilinčanov tak zaujme piaty tím Corgoň ligy FC Nitra.  
Funkcionári nitrianskeho klubu už podali prihlášku do tejto súťaže. V 1. kole sa Nitrania stretnú s luxemburským klubom CS Grevenmacher, termíny prvých zápasov sú 17. a 18. júna, odvety sú na programe o týždeň neskôr. FC Nitra začína dvojzápas proti luxemburskému súperovi zápasom na domácom ihrisku.