Medzi 14 osobami, ktorých prevezú z väzníc CIA na Guantánamo, sa nachádzajú aj tri "veľké ryby" Al-Kajdy.
Chálid šajch Muhammad: Považujú ho za muža číslo 3 v Al-Kajde a za hlavu teroristického útoku na USA 11. septembra 2001. Zatkli ho na prelome februára a marca 2003 v Pakistane.
Abú Zubajdá: Palestínčan, narodený v Saudskej Arábii, bol šéfom pre vonkajšie záležitosti Al-Kajdy. V jej hierarchii bol na štvrtom mieste. Z veliteľstva v Afganistane dal údajne v roku 2001 príkaz na prípravu atentátov na americké ciele vo Francúzsku. Zatkli ho 28. marca 2002.
Ramzí bin Šibh: Po Jemenčanovi, ktorý bol členom Al-Kajdy, pátrali Spojené štáty aj Nemecko pre údajnú účasť na plánovaní teroristických útokov na USA z 11. septembra 2001. Býval v byte s Muhammadom Attom, ktorý bol jedným z pilotov unesených lietadiel. Šibha zatkli presne rok po atentátoch.