Rudolfa Schustera si za prezidenta zvolili obyvatelia už v prvej priamej voľbe hlavy štátu.
Na čele Slovenska bol od roku 1999 do 2004. Schuster sa v druhom kole volieb stretol s Mečiarom, keďže ani jeden z nich nedostal v prvom kole nadpolovičnú väčšinu hlasov.
Schuster Mečiara porazil so ziskom vyše 47 percent hlasov.
O rok neskôr sa však už uvádzalo, že jeho popularita rapídne klesá. Keď ešte v septembri 2000 mu popularitu vyjadrilo cez 31 percent opýtaných, o mesiac neskôr to už bolo o desať percent menej, ako zistila agentúra MVK. Prvenstvo vtedy získal Mečiar.
Podľa údajov agentúry Focus, Schuster mal svoju bodku obľúbenosti najvyššiu v roku 1999, odkedy už klesal. Schuster sa na rozdiel od Kováča rozhodoval kandidovať na ďalšie funkčné obdobie až do volebného zápasu.
V roku 2004 ho podľa prieskumu verejnej mienky považovalo za dôveryhodného 5,5 percent voličov, na porovnanie, Mečiara vyše 13 percent a najdôveryhodnejším politikom bol Robert Fico.
Podľa výskumu MVK sa Schuster zas pohyboval nad 11 percentami. Do volieb kandidoval opakovane bez podpory žiadnej strany ako politický aj občiansky kandidát.
Jeho podpora klesala a nakoniec získal menej ako desať percent hlasov.